Von 1962 bis 1970
war Jan Szarek Pfarrer in der Kirchengemeinde
Giżycko
(Lötzen), und von 1970 bis 1975 Diözesanvikar in
Bielsko-Biała (Bielitz).
1984 wurde er kirchlicher Konsistorialrat und auch Vorsitzender im
Förderrat des Diakonats "Eben-Ezer" in
Dzięgielów.
Am 6. Januar
1991 wählte ihn die Kirchensynode zum
Bischof
der
Evangelisch-Augsburgischen Kirche in Polen.
Bis zum Jahre 2001 hatte er dieses Amt inne, bevor er es an
Janusz
Jagucki
weitergab. Im gleichen Jahr endete auch sein Amt als Vorsitzender
der Diakonie der Evangelisch-Augsburgischen Kirche in Polen.
Im Jahr 2001 erhielt Jan Szarek die Ehrendoktorwürde der Christlich-Theologischen Akademie in Warschau.